用RAPD技术对BT型水稻胞质雄性不育系秀A及其保持系秀B、恢复系湘晴以及杂种F1代的线粒体DNA进行了比较分析。结果表明不育系与其保持系间存在显著差异；不育系与其F1之间mtDNA也存在差异。在引物OPJ－08的扩增产物中，秀A扩增出一条分子量为800bp的多态性片段，在引物OPK－10的扩增产物中，杂种F1扩增出一条分子量为900bp的片段。把这两片段回收、克隆并制备探针，OPJ－08800的Southern杂交结果显示不育系与其F1杂交图谱存在多态性；OPK－10900的Suthern杂交结果显示不育系与其保持系同存在差异。推测这两片段与育性可能有一定的联系。