采用SSR和杂种优势聚类方法分析我国15个玉米骨干自交系的遗传变异，并初步进行了杂种优势类群划分，从62个SSR引物中筛选的40对有效引物对15个玉米自交系进行了分析，共检测到188个等位基因变异，每个SSR座位的等位基因数2－9个，平均为4．7个，SSR位点的多态信息含量PIC值平均为0．675，分布范围在0．360－0．851之间，根据SSR数据对供试材料进行遗传相似性分析，Nei氏相似性系数分布在0．574－0．777之间，10对多态性高的SSR引物可有效区分15个自交系，应用SSR聚类分析的结果与系谱关系相一致，与杂种优势类法相比较，SSR方法具有效率高，结果可靠，可标准化的特点，对SSR方法在玉米育种实践上的应用进行了初步探讨。