以29份普通小麦、野生二粒小麦及野生二粒小麦与节节麦杂交的双二倍体为材料，选取A、B染色体组特异的SSR引物，通过微卫星多态性检测方法探讨上述两物种之间A、B染色体组的遗传进化关系。经NTSYS系统软件UPGMA聚类分析表明，在遗传相似系数为0．18时可以将普通小麦与野生二粒小麦大致分为两大类群，说明野生二粒小麦的A、B染色体组在进化过程中其遗传物质发生了较大变化，但同时野生二粒小麦的D25与D13与普通小麦分为一组，尤其是D13与新疆的红冬麦遗传距离较近，也证明了其两物种间有一定的同源性，并对这些遗传物质分化发生的机制及SSR引物的保守性进行了讨论。