通过对喜树幼苗中喜树碱含量的分析，发现不同生长期、不同器官中喜树碱的含量不同，幼叶和根中喜树碱的含量较高。虽然喜树中含有对真核细胞具有毒性作用的喜树碱，但仍有12种内生菌从喜树的不同器官中分离出来。内生菌对喜树碱的敏感性实验表明，10μg／mL喜树碱对2种内生菌的生长几乎没有抑制作用，即是100μg／mL浓度的喜树碱对它们的生长抑制也是有限的。