亚麻EST序列中SSR标记的筛选
DOI:
作者:
作者单位:

作者简介:

通讯作者:

中图分类号:

Q789

基金项目:

现代农业产业技术体系专项基金,甘肃省农业生物技术研究与应用开发项目,甘肃省自然科学科学基金,油料作物品种创新及产业化发展研究创新团队项目?


Screen of SSR Markers from EST of Flax (Linum usitatissimum L.)
Author:
Affiliation:

Fund Project:

  • 摘要
  • |
  • 图/表
  • |
  • 访问统计
  • |
  • 参考文献
  • |
  • 相似文献
  • |
  • 引证文献
  • |
  • 资源附件
  • |
  • 文章评论
    摘要:

    利用亚麻NCBI数据库中的7 941条亚麻EST序列进行SSR的筛选,共发现222个SSR,占整个EST数据库的2.73%,其中三核苷酸重复单元的EST-SSR占总SSR的72.1%,二核苷酸和四核苷酸二者出现的频率基本相近,分别占总SSR的14.4%和13.5%.AGAA是四核苷酸中的优势重复类型,占四核苷酸重复类型的67.67%.设计的21对EST-SSR引物中有18对在10个亚麻材料中有扩增产物,占设计引物的85%,有14对产物条带比较清晰并具有多态性.基于SSR标记进行聚类分析,可将10个亚麻材料划分为3个组.本研究建立的亚麻SSR标记,为亚麻遗传多样性鉴定、分子作图等研究提供了一种有效的分子标记系统.

    Abstract:

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

张建平,王斌,赵丽娟,等.亚麻EST序列中SSR标记的筛选[J].西北植物学报,2009,29(5):

复制
分享
文章指标
  • 点击次数:
  • 下载次数:
  • HTML阅读次数:
  • 引用次数:
历史
  • 收稿日期:
  • 最后修改日期:
  • 录用日期:
  • 在线发布日期:
  • 出版日期:

微信公众号二维码

手机版网站二维码