草莓miR390靶基因TAS3的克隆及表达分析
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国家自然科学基金(31101524);中国博士后科学基金(20100481212,2012T50270);辽宁省创新团队项目(LT2010094)


Cloning and Expression Analysis of miR390-Targeted TAS3 Gene from Strawberry
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    摘要:

    以栽培草莓品种‘全明星’为试材,通过3′-和5′-RACE技术克隆出miR390靶基因TAS3的cDNA全长,命名为FaTAS3。序列分析发现:草莓TAS3基因的cDNA全长为742 bp,含有16个碱基的Poly A尾巴及2个高度保守的ta-siRNA产生位点和1个miR390靶位点;该基因DNA全长为824 bp,5′ 端130 bp处有一个98 bp的内含子序列。生物信息学软件预测显示,草莓TAS3基因的启动子除具有TATA/CAAT-box外,还含有G-box、C-box等特异作用元件。实时定量RT-PCR结果表明,草莓miR390与靶基因TAS3间的表达模式与拟南芥中的表达模式相同,推测草莓TAS3基因的生物合成也受miR390的指导。

    Abstract:

    The miR390-targeted TAS3 gene named FaTAS3 was isolated from strawberry (Fragaria ananassa ‘Allstar’) with the methods of PCR and RACE.Sequence analysis showed that the cDNA was consisted of a 742 base pair with a 16 bp poly A and highly conserved domains,two ta-siRNA-generating regions and one miR390 complementary site.The full-length DNA of FaTAS3 is 824 bp with an intron sequence of 98 bp at the 130 bp from the 5′ end of TAS3 transcript.In addition to the TATA/CAAT-box,its promoter predicted by bioinformatic analyses also contained some specific regulatory elements such as G-box,C-box and etc.The results of real time RT-PCR showed that the expression pattern of miR390 and its targeted TAS3 gene in strawberry is a similar manner to Arabidopsis.So we deduce that the biological formation of strawberry TAS3 gene was also cleaved by miR390.

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

李 贺,毛健鑫,戚华彩,等.草莓miR390靶基因TAS3的克隆及表达分析[J].西北植物学报,2013,33(11):2153-2158

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  • 在线发布日期: 2013-12-16
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