在玉米单交种育种中，鉴定高产杂交种和具有优良特性的自交系是一个重要的问题。研究以１７个优良玉米自交系为亲本，按照双列杂交配组合，利用ＲＡＰＤ技术分析１７个自交系的多态性以及ＲＡＰＤ标记与９个重要农艺性状（包括产量）的关系。基于ＲＡＰＤ标记计算的相似系数聚类将１７个自交系分为５个类群，经分析与系谱关系基本一致。杂交种性状及其特殊配合力与亲本间的遗传距离是高度相关的，与聚类前比较，聚类后平均遗传距离与