对玉兰亚属的17个种进行RAPD标记实验的结果表明，RAPD标记在玉兰亚属内具有很高的多态性，证明RAPD标记可作为木兰科低等级分类单元的分类依据，聚类分析结果显示，分布于美洲的渐叶木兰与其它分布于亚洲的种类明显分开，滇藏木兰与亚洲的其余15个种也具有较远的亲缘关系，其余各个种各自聚类，种间均有着不同的遗传距离，RAPD及分子序列测定分析结果均不支持玉兰亚属以萼片状花被片，开花时间，花被片颜色作为分组的依据，建议玉兰亚属以地理分布特征作为分组依据，建立亚洲组与美洲组两个类群。