利用SSR标记对分布在我国7个省的17个居群普通野生稻(Oryza rufipogon Griff．)的种质资源进行研究，结果表明：17个居群普通野生稻的遗传多样性有着显著的差异，从UPGMA聚类结果可以看出普通野生稻的遗传多样性与其生态地理分布有显著的相关性，遗传多样性指数高的地区极有可能是栽培稻的起源中心；用筛选出的7对SSR引物对336份：DNA样品进行扩增，得到60条特异条带，在分子水平上进一步证明普通野生稻的起源为两广地区；本研究也表明SSR是进行遗传资源多样性研究的一种切实有效的研究方法。