应用RAPD技术，对新疆阜康荒漠地区叉毛蓬进行了居群遗传分析。结果表明：①用14个随机引物对5个叉毛蓬亚居群的98个个体进行了RAPD扩增，共检出3919条扩增片段，多态带3868条，总的多态位点百分率为98．7％；②Shannon多样性指数(HPOP／HSP＝0．6933)和Nei基因多样性指数(HS／HT＝0．6948)显示出大部分的遗传变异存在于叉毛蓬亚居群内，遗传分化系数(GST＝o．3052)表明亚居群问的分子变异占居群总遗传变异的30％以上；②5个叉毛蓬亚居群间的平均遗传距离为0．1817，变异范围从0．1258到0．2445，与同一物种亚种间遗传距离的变幅较一致(0．02—0．20)，表明5个亚居群间产生了遗传分化；④叉毛蓬亚居群的基因流Nm＝1．138，低于一般广布种的基因流水平(Nm＝1．881)，且远低于毛乌素沙地柠条的基因流(Nm＝5．9529)，相对有限的基因流可能在叉毛蓬居群遗传分化的维持中起着作用。以上分析表明，尽管大部分的遗传多样性存在于叉毛蓬亚居群内，但5个亚居群间已有明显遗传分化的趋势。