小麦胁迫相关基因TaSF3B2的克隆及表达特性分析
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国家转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08002001)


Molecular Cloning and Expression Analysis of TaSF3B2 from Wheat
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    摘要:

    为研究小麦剪接因子在逆境胁迫中的作用,通过分析小麦抗性相关EST数据库,筛选并克隆获得1条2 327 bp的核苷酸序列。该序列包含了一个1 854 bp的开放阅读框,编码一个由617个氨基酸残基组成的蛋白,氨基酸同源比对发现,该蛋白含有GUS1结构域(Splicing Factor 3B, Subunit 2),属于剪接因子3b亚基中的一员,将该蛋白命名为TaSF3B2。生物信息学分析显示,TaSF3B2平均亲水系数(GRAVY)为-0.895,不稳定系数为43.92,且在细胞核中发挥作用的可能性最大。实时荧光定量PCR分析表明,TaSF3B2基因在不同组织中存在差异表达,不同发育时期其表达也存在差异;在幼苗叶片中,该基因表达受高盐、低温、条锈菌、干旱及ABA激素胁迫明显下调表达,而在幼苗根中变化不明显。推测TaSF3B2基因参与了小麦正常条件下的生长发育,同时在小麦应对逆境胁迫的过程中具有重要的作用。

    Abstract:

    To study the function of splicing factor responses to abiotic stress, a cDNA sequence of TaSF3B2 was isolated and analyzed from wheat EST database. The results showed that TaSF3B2 contained a 1 854 bp ORF encoding 617 amino acids. Using the methods of bioinformatics to predict and analyze TaSF3B2, the protein has classic domain of splicing factor 3B subunit 2, high hydrophilia (GRAVY, -0.895) and heat stability (Instability index, 43.92). The results of realtime PCR revealed that the expression of TaSF3B2 had different levels in different developments and tissues. In addition, the expression was induced markedly by drought, salt, lowtemperature, ABA and yellow rust (CY32),with downregulation in leaves of seedling, but no change in root. In summary, it is speculated that TaSF3B2 could play a role not only in growth and development conditions but also in biotic and abiotic stresses of wheat.

    参考文献
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    引证文献
引用本文

黄 鑫,夏百成,龙翔宇.小麦胁迫相关基因TaSF3B2的克隆及表达特性分析[J].西北植物学报,2016,36(8):1528-1533

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  • 在线发布日期: 2016-08-30
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